柯基从包里翻出主人的毕业证后咬烂，可能有以下几个原因。第一，柯基对于主人的行为有反应，当主人从包里拿出毕业证时，柯基可能误以为是一种游戏或者是可以一起玩耍的东西，因此出于好奇或兴奋而咬烂了毕业证。第二，柯基可能有焦虑或不安的情绪，当主人拿出毕业证时，柯基可能因为不熟悉这个物品而感到紧张或恐惧，咬烂毕业证可能是一种发泄或逃避的行为。第三，柯基可能出于注意力引导或者寻求主人关注的目的而咬烂毕业证，柯基可能意识到主人对此物品有重要的情感连接，通过咬烂毕业证，柯基希望引起主人的注意并获得互动。无论原因如何，柯基咬烂主人的毕业证是一种不良行为，需要通过适当的训练和行为矫正来改变这种行为习惯。